許多人都曾有這個煩惱？到底吃下肚的益生菌，會不會被抗生素殺死呢？能一起吃嗎？還是要間隔多久呢？
不同益生菌對抗生素的耐受性大不同
一般來說，大部分的益生菌都會怕抗生素，就連之前被喻為耐性益生菌的腸球菌，對於beta-lactam(例如,amoxicillin)的抗生素比較具有耐受性，但對其它類抗生素就不具耐受性(如FQ類、Vancomycin)。
Clostridium butyricam MIYAIRI 588則對cepha類抗生素有點耐受性，但卻不敵常見的ampicillin抗生素。而B. bifidum G9-1、L. acidophilus 4AR及B. infantis SMR對大部分的抗生素都不具耐受性。
至於平常我們常當作保健的乳桿菌屬(Lactobacillus)、B菌(Bifidobacterium species)、C菌(L. casei)及其它常見益生菌對抗生素的耐受性。
Lactobacillus中的L. reuteri對penicillins及第三代cepha有耐性，大部分Lactobacillus菌屬對於ciprofloxacin、levofloxacin有耐性，而全部Lactobacillus菌屬均對metronidazole及co-trimoxazole有抗藥性。
Bifidobacterium對ciprofloxacin有耐受性，但不耐Levofloxacin，且對其它抗生素大部皆具有感受性，最有趣的一點是，Bifidobacterium不耐metronidazole(大部分益生菌都對metronidazole都具有耐受性)。
Bacillus菌屬(芽孢桿菌)對cepha、巨環類、clindamycin、metronidaozle有抗藥性。大家可以仔細看，不難發現，事實上大部分益生菌對oxacillin及metronidazole有抗藥性，尤其是metronidazole，所以如果是平常服用的A菌、C菌、L. reuteri、LGG，事實上比較不用擔心metronidazole抗生素會影響益生菌的效果(除了Bifidobacterium菌屬)。
在研究的所有益生菌配方中，只有Saccharomyces boulardii yeast不怕大部分的抗生素，但抗黴菌藥物會影響其作用。
而該篇研究顯整理出一張非常實用的表格，左列為常見的益生菌，上排為臨床上常使用的抗生素，表中標示為紅色方塊代表該益生菌對於對應的抗生素具有感受性(會怕這個抗生素)，所以大家也可以找找看，自己服用的益生菌是否會怕你目前服的抗生素唷。
至於是不是間隔2小時或4小時服用，益生菌就不受抗生素影響呢？答案是否定的。因為在正確的用藥頻率下，腸道黏膜隨時都有足量的抗生素濃度，來破壞吞下肚的益生菌。
